北京安贞医院由我国胸心血管外科奠基人吴英恺院士所创立，是以治疗心肺血管疾病为重点的三级甲等综合性医院，专科特色突出，多学科综合实力强劲，在中国心血管领域处于领军地位。
1984年4月14日，北京安贞医院正式成立，与北京市心肺血管中心为一个联合体。吴英恺院士被北京市卫生局党组任命为首任院长；同年11月20日，经北京市卫生局党组批准，中共北京安贞医院委员会正式成立，北京市心肺血管医疗研究中心与北京安贞医院为一个党委，王登弟任第一任党委书记。
北京安贞医院从最开始仅有一个“工字楼”起步，建院仅3年心外手术例数突破600例，确立了在综合医院的领军地位，建院7年就完成了院内第一例、国内第二例心脏移植手术，打破了沉寂14年之久的医学禁区。在医院四十年发展历程中，逐步经历了“大专科、小综合”、“强专科、大综合”、“强专科、优综合”的各阶段特色，形成了心血管学科优势突出、综合学科蓬勃发展的局面。
1996年，吴英恺老院长提出了“公勤严廉”的院训，“公”是公正、公平、一心为公、公而忘私；“勤”是勤奋、勤快、勤劳、勤学；“严”是严肃、严谨、严格、严密；廉就是廉洁自律、廉洁行医，这也成为安贞人的精神源头和文化底色。
作为北京疏解非首都功能、优化北京城市副中心布局的重点建设项目，北京安贞医院通州院区位于城市副中心北部宋庄镇，紧邻河北廊坊北三县，总建筑面积约34万平方米，编制床位1300张，历经4年建设历程，于2024年10月19日正式开诊。通州院区立足副中心，辐射京津冀，进一步优化医疗卫生资源布局，承担起副中心及周边京津冀人群心血管急危重症救治和基本医疗保障任务。
医院现为国家心血管疾病临床医学研究中心，国家区域医疗中心建设输出医院，2021年以来连续三年心脏内科和心脏外科单中心手术例数位居全国第一，医疗质量位于全国前列，临床能力达到国际一流，努力打造心血管疾病救治的最后一站。
医院现有职工4000余人，现有北京学者、国自然杰青、突贡等省部级以上人才70余人。拥有国家重点学科1个（心血管内科），国家临床重点专科5个（心血管内科、心脏大血管外科、老年病科、妇科、重症医学科），省级临床重点专科7个（儿科、心血管内科、重症医学科、医学影像科、医学检验科、流行病学、麻醉科），北京市质控中心2个（体外生命支持、心血管内科）。
医院是首都医科大学第六临床医学院和护理学院第十临床教学部。有博士生培养点18个，博士生导师88人；硕士生培养点32个，硕士生导师223人。在院学生1900余人。有北京市住院医师规范化培训基地16个，国家专科医师规范化培训基地3个。多年来，医院为全国各地培养了万余名高水平的心肺血管相关学科人才。
医院拥有科技部创新团队、科技部创新人才培养示范基地、教育部心血管重塑相关疾病重点实验室、教育部心血管疾病生物医学工程实验室等5个国家级平台和17个省部级平台。建设专病数据库及样本库，建设医企联合实验室，构建产、学、研、医协同创新体系。建立了全国规模最大的冠心病专病队列、房颤队列。
作为全球最大的心脏中心，北京安贞医院心血管疾病诊疗规模、质量均位居世界领军地位。通州、朝阳两院区将实行一体化发展模式，不断向着科研型、创新型医院转型，矢志打造心血管疾病救治的最后一站！
